Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ckap2lQ7TS74 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ckap2lQ7TS74 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms