Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Actn1Q7TPR4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms