Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNS8

Epop, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EpopQ7TNS8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EpopQ7TNS8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms