Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNM2

Trim46, Tripartite motif-containing protein 46, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim46Q7TNM2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim46Q7TNM2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim46Q7TNM2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms