Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp397Q7TNK4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms