Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMY7

Ipo8, Importin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,010 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ipo8Q7TMY7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ipo8Q7TMY7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms