Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMX5

Shq1, Protein SHQ1 homolog, mousemouse

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Length 569 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shq1Q7TMX5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Shq1Q7TMX5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Shq1Q7TMX5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Shq1Q7TMX5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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