Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Uhrf2Q7TMI3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Uhrf2Q7TMI3 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms