Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Vma21Q78T54 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Vma21Q78T54 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vma21Q78T54 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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