Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ubfd1Q78JW9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ubfd1Q78JW9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ubfd1Q78JW9 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ubfd1Q78JW9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Ubfd1Q78JW9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ubfd1Q78JW9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ubfd1Q78JW9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ubfd1Q78JW9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ubfd1Q78JW9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ubfd1Q78JW9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ubfd1Q78JW9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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