Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RfflQ6ZQM0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RfflQ6ZQM0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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