Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Topbp1Q6ZQF0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Topbp1Q6ZQF0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms