Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ08

Cnot1, CCR4-NOT transcription complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot1Q6ZQ08 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cnot1Q6ZQ08 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms