Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ino80Q6ZPV2 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ino80Q6ZPV2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms