Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPI3

Lcor, Ligand-dependent corepressor, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcorQ6ZPI3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LcorQ6ZPI3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LcorQ6ZPI3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms