Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Timd4Q6U7R4 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms