Protein–RNA interactions for Protein: Q6SJQ5

Cd300ld3, CMRF35-like molecule 3, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ld3Q6SJQ5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd300ld3Q6SJQ5 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd300ld3Q6SJQ5 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms