Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFC5

Lrit2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 549 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit2Q6PFC5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrit2Q6PFC5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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