Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gramd2bQ6PEM6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gramd2bQ6PEM6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms