Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc85bQ6PDY0 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms