Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDK8

Dtx4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, mousemouse

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx4Q6PDK8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dtx4Q6PDK8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Dtx4Q6PDK8 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Dtx4Q6PDK8 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms