Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SvoplQ6PDF3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms