Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Zbtb40Q6PCS8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zbtb40Q6PCS8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 236.3 ms