Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Bhlhb9Q6PB60 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms