Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAV2

Herc4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, mousemouse

Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc4Q6PAV2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Herc4Q6PAV2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Herc4Q6PAV2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms