Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Atl2Q6PA06 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atl2Q6PA06 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms