Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9Z1

Smarcd3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd3Q6P9Z1 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcd3Q6P9Z1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcd3Q6P9Z1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcd3Q6P9Z1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcd3Q6P9Z1 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcd3Q6P9Z1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcd3Q6P9Z1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcd3Q6P9Z1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcd3Q6P9Z1 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcd3Q6P9Z1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcd3Q6P9Z1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcd3Q6P9Z1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcd3Q6P9Z1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcd3Q6P9Z1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcd3Q6P9Z1 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Smarcd3Q6P9Z1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcd3Q6P9Z1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcd3Q6P9Z1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcd3Q6P9Z1 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Smarcd3Q6P9Z1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smarcd3Q6P9Z1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd3Q6P9Z1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd3Q6P9Z1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd3Q6P9Z1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Smarcd3Q6P9Z1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms