Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smchd1Q6P5D8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Smchd1Q6P5D8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
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