Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A8

Bckdhb, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhbQ6P3A8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BckdhbQ6P3A8 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BckdhbQ6P3A8 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms