Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D7

Slx4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, mousemouse

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4Q6P1D7 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Slx4Q6P1D7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Slx4Q6P1D7 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms