Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Asic1Q6NXK8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms