Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rprd2Q6NXI6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rprd2Q6NXI6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms