Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gpbp1Q6NXH3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gpbp1Q6NXH3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms