Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcd11Q6NS46 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcd11Q6NS46 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcd11Q6NS46 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcd11Q6NS46 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcd11Q6NS46 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcd11Q6NS46 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcd11Q6NS46 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcd11Q6NS46 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcd11Q6NS46 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pdcd11Q6NS46 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcd11Q6NS46 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcd11Q6NS46 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcd11Q6NS46 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcd11Q6NS46 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcd11Q6NS46 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcd11Q6NS46 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcd11Q6NS46 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdcd11Q6NS46 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pdcd11Q6NS46 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pdcd11Q6NS46 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Pdcd11Q6NS46 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Pdcd11Q6NS46 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms