Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CltbQ6IRU5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms