Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Smarca2Q6DIC0 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Smarca2Q6DIC0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smarca2Q6DIC0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms