Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nop58Q6DFW4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nop58Q6DFW4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms