Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Usp7Q6A4J8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp7Q6A4J8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms