Protein–RNA interactions for Protein: Q6A078

Cep290, Centrosomal protein of 290 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep290Q6A078 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Cep290Q6A078 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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Cep290Q6A078 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Cep290Q6A078 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Cep290Q6A078 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
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Cep290Q6A078 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Cep290Q6A078 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Cep290Q6A078 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Cep290Q6A078 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cep290Q6A078 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Cep290Q6A078 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cep290Q6A078 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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