Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmcc1Q69ZZ6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms