Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pkp4Q68FH0 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Pkp4Q68FH0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
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Pkp4Q68FH0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Pkp4Q68FH0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Pkp4Q68FH0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pkp4Q68FH0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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