Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Atg9aQ68FE2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg9aQ68FE2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg9aQ68FE2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg9aQ68FE2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg9aQ68FE2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg9aQ68FE2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg9aQ68FE2 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg9aQ68FE2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg9aQ68FE2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg9aQ68FE2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg9aQ68FE2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg9aQ68FE2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg9aQ68FE2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg9aQ68FE2 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg9aQ68FE2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg9aQ68FE2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg9aQ68FE2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg9aQ68FE2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg9aQ68FE2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Atg9aQ68FE2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Atg9aQ68FE2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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