Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CltcQ68FD5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CltcQ68FD5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms