Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sbno1Q689Z5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Sbno1Q689Z5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
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