Protein–RNA interactions for Protein: Q66K08

Cilp, Cartilage intermediate layer protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CilpQ66K08 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CilpQ66K08 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CilpQ66K08 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms