Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Top2bQ64511 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Top2bQ64511 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms