Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sf1Q64213 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sf1Q64213 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms