Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PatjQ63ZW7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PatjQ63ZW7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms