Protein–RNA interactions for Protein: Q63871

Polr2k, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2kQ63871 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Polr2kQ63871 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms