Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ift52Q62559 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ift52Q62559 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms